U usporedbi sa adaptivnim imunološkim sistemom, može se boriti protiv većeg broja patogena, ali je pružena zaštita kratkotrajnija. Granulociti, makrofagi, prirodne stanice ubice i sistem, komplementa dio su urođenog imunološkog sistema.

Granulocite dijelimo na neutrofile, eozinofile i bazofile. Broj neutrofila u ljudskom tijelu je najveći među ova tri i oni se proizvode vrlo velikom brzinom. Oni također prvi reagiraju nakon infekcije i igraju ulogu "opće policije" u urođenom imunitetu. Eozinofili su vrlo efikasni u borbi protiv parazita. Paraziti su višestanični organizmi koje je teško progutati. Međutim, eozinofili ne uništavaju parazite fagocitozom (gutanjem). Umjesto toga, oslobađaju hemikalije koje prodiru kroz staničnu membranu i napadaju je. Stoga je uloga eozinofila više poput "dezinfikatora".

Bazofili pokreću upalni odgovor tijela ispuštanjem hemikalija i čest su faktor u alergijskim reakcijama. Oni su poput "vatrogasaca" koji se uključuju kada se neko područje zapali (kao kada nešto doslovno gori). Funkcija makrofaga je provođenje fagocitoze, koja može progutati patogene u velikim količinama. U usporedbi sa neutrofilima, makrofagi su snažniji u eliminaciji patogena i mogu se boriti protiv patogena duže vrijeme. Osim makrofaga, dendritične stanice također gutaju patogene.

Nakon što progutaju patogen, makrofagi i dendritične stanice će ga analizirati i proslijediti relevantne informacije adaptivnom imunološkom sistemu, omogućavajući mu da se dalje nosi sa neprijateljem. Oni su "komunikacijski most" između urođenog i adaptivnog imunološkog sistema. Iako oba imaju slične funkcije, svaki ima svoje prednosti. Makrofagi imaju jaču fagocitnu sposobnost, poput "interventne policije", dok dendritične stanice imaju bolje sposobnosti analize i prijenosa, poput "signaliste" koji isporučuju poruke.

Prirodne stanice ubice također su jedna od naprednih trupa, a njihova glavna funkcija je ubijanje stanica zaraženih virusom i mutiranih stanica raka u tijelu. Sistem komplementa je poput "metka" koji može ubiti razne patogene, bakterije, viruse ili abnormalne stanice. Osim toga, može poboljšati sposobnost fagocita da progutaju patogene opsonizacijom. Jednostavno rečeno, ako su patogeni bijela riža, sistem komplementa je poput umaka koji dodaje okus, potičući fagocite da jedu više. Štaviše, sistem komplementa može potaknuti druge imunološke reakcije, kao što su upalne reakcije, izlučivanje tvari koje reguliraju imunološke funkcije i tako dalje.

Adaptivni imunološki sistem je ustvari dobro uvježbana "specijalna snaga" sposobna uništiti određene patogene (sa imunološkom specifičnošću). Urođeni imunološki sistem će preuzeti vodstvo u borbi kada se susretne sa nepoznatim izvorom infekcije.